Cheminės fizikos instituto Bendrosios fizikos ir spektroskopijos katedros studentų darbų gynimo posėdis.

Sausio 24 d. 9 val, NFTMC B336 auditorijoje kviečiamas Cheminės fizikos instituto Bendrosios fizikos ir spektroskopijos katedros posėdis

Darbotvarkėje:

2. Magistrų praktikos darbų gynimas sausio 24 d., 9.00 val.,
3. Bakalaurų kursinių darbų gynimas sausio 24 d., 11.00 val.,

Galutinai parengtus darbus (vadovo pasirašytus !) atnešti į B318 kab. iki sausio 22 d., 12.00 val.

Jeigu darbo aptarime nedalyvaus studento darbo vadovas reikalingas raštiškas darbo vadovo atsiliepimas su įvertinimu

DNR užuolaidos – platforma DNR ir baltymų tyrimams pavienių molekulių fluorescencinei mikroskopijai.

Pavadinimas: DNR užuolaidos – platforma DNR ir baltymų tyrimams pavienių molekulių fluorescencinei mikroskopijai.

Pranešėjas: Marijonas Tutkus.

Santrauka:

Baltymų ir nukleorūgščių (NR) sąveika yra svarbi visų pagrindinių ląstelės funkcijų reguliacijai. Šiuolaikiniai pavienių molekulių fluorescencinės mikroskopijos (PMFM) metodai leidžia realiu laiku studijuoti individualios baltymo molekulės elgesį surišant NR taikinį. Tačiau šie metodai yra techniškai sudėtingi ir juos ne visada pasiseka lengvai pritaikyti. PM eksperimentų metu, dėl neigiamos paviršiaus ar žymėjimo įtakos Tiriamosioms molekulėms, dažnai sunku surinkti tiek duomenų kad registruojami pokyčiai būtų statistiškai reikšmingi. „DNR užuolaidos” yra tolimesnis PMFM metodo vystymosi etapas, kuris leidžia pasiekti didesnį tyrimo našumą. „DNR užuolaidos“ yra prie stiklo pritvirtinti ir tam tikru būdu išdėstyti NR fragmentai, kurie ištiesiami horizontaliai paviršiui naudojant buferio tėkme.  Pritvirtintų NR fragmentų išsidėstymą ir tankį galima reguliuoti. Ant šios platformos užleidus fluorescentiškai žymėtą baltymą, sąveiką su NR galima stebėti tiesiogiai PMFM pagalba. Metodas leidžia išvengti sudėtingo tiriamo baltymo žymėjimo – užtenka prijungti kvantinį tašką (KT) prie baltymo. Numatoma, kad mūsų platforma pirma bus išbandyta naudojant anksčiau charakterizuotus su NR sąveikaujančius baltymus (BcnI, Bse634), o vėliau pritaikyta ir naujiem objektams. Matavimo sistema leidžia stebėti iškart daug individualių baltymo ir NR sąveikų. Šio naujo metodo potencialas NR – baltymų sąveikos tyrimams yra didžiulis (atskleidžia informaciją apie taikinio paieškos mechanizmus, sąveikos konstantas ir kt.) ir todėl jis nenustojamai vystomas.

Čia pristatysiu unikalią stiklo paviršiaus nanostruktūrizavimo technologiją, leidžiančią sukurti „DNR užuolaidų“ platformą įvairioms NR ir baltymų sąveikoms tirti PMFM pagalba. Taip pat pristatysiu technines kliūtis, su kuriomis susiduriame šiuo metu optimizuodami paviršiaus modifikavimo ir struktūrizavimo metodus. Bei pateiksiu metodo taikymo pavyzdžių.

Data, laikas  ir vieta: 2017-12-15, 14:00, NFTMC A101 auditorija.

Organizuoja: MDFS ir VU FF TFK (Cheminės fizikos institutas).

Kontaktai: marijonas.tutkus@ftmc.lt

Elektronų ir protonų pernašos greitis oksidoreduktazių katalizuojamose biocheminėse reakcijose: teoriniai modeliai ir eksperimentinių tyrimų problemos

Kviečiame į  paskutinį šį semestrą  Cheminės fizikos seminarą. Seminaras vyks  kitos savaitės trečiadienį, gruodžio 13 d., tačiau atkreipkite dėmesį į netradicinį laiką – _12:30_. Seminaro vieta nesikeičia – B336 NFTM Centre.

Paskutinį pranešimą šiais metais perskaitys svečias iš Gyvybės mokslų centro – jaun. m. darb. Audrius Laurynėnas, todėl seminaras turėtų suintriguoti ypač tuos, kurie domisi chemofizikiniais procesais gyvuose organizmuose.

Pranešėjas: Audrius Laurynėnas [VU Gyvybės mokslų centras]

Tema: Elektronų ir protonų pernašos greitis oksidoreduktazių katalizuojamose biocheminėse reakcijose: teoriniai modeliai ir eksperimentinių tyrimų problemos

Anotacija: Oksidoreduktazės yra labai įdomūs baltymai, kurie katalizuoja bene labiausiai gamtoje paplitusią cheminių reakcijų klasę – oksidacijos ir redukcijos reakcijas. Šių reakcijų metu vyksta elektronų ir protonų pernaša nuo vieno fermento substrato kitam. Šios reakcijos yra įdomios tiek teoriniu, tiek praktiniu požiūriu. Geresnis jų supratimas leistų racionaliai modifikuoti dabar žinomus baltymus ir jų pagrindų kurti naujas bio(elektro)katalizines sistemas su potencialiai beribiu pritaikymu tiek pramonėje, tiek moksliniuose tyrimuose. Prieš pusę šimto metų, R. A.  Marcus sukūrė krūvio pernašos teoriją, kuri šiuo metu yra pagrindinis teorinis įrankis, leidžiantis suprasti elektronų ir protonų pernašos reakcijas įvairiose sistemos.

Seminaro metu ši teorija bus apžvelgiama iš biochemiko (sic!) perspektyvos. Bus aptarti jos pritaikymai tiriant ir suprantant įvairių oksidoreduktazių veikimo mechanizmus.

Maloniai kviečiame dalyvauti

Vandens struktūrų funkcinėse medžiagose tyrimas taikant virpesinę spektrometriją

Kviečiame į  Cheminės fizikos seminarą, vyksiantį ateinantį trečiadienį, gruodžio 6 d., 12:00 val. NFTMC B336 seminarų kambaryje.

Pranešėjas: dokt. Jonas Kausteklis [VU Cheminės fizikos institutas]

Tema: Vandens struktūrų funkcinėse medžiagose tyrimas taikant virpesinę spektrometriją

Anotacja: Pranešimo metu bus aptariamos virpesinės spektrometrijos panaudojimo galimybės tiriant vandens ir funkcinių medžiagų (joninių skysčių, hidroksiapatitų) sąveikas. Taip pat bus apžvelgti vandens struktūrų funkcinėse medžiagose formavimosi ypatumai.

Maloniai kviečiame dalyvauti ir dalintis prikabintu seminaro skelbimu.

EXCITON DYNAMICS AND RELAXATION IN PHOTOSYNTHETIC LIGHT-HARVESTING COMPLEXES

Pavadinimas: EXCITON DYNAMICS AND RELAXATION IN PHOTOSYNTHETIC LIGHT-HARVESTING COMPLEXES.

Pranešėjas: Egidijus Songaila.

Data, laikas  ir vieta: 2017-11-27, 14:00, NFTMC D401 auditorija.

VLADIMIR CHOROŠAJEV gins daktaro disertaciją

Rytoj, penktadienį, lapkričio 24 d. 15 val. NFTMC A101 salėje, Saulėtekio al. 3, VLADIMIR CHOROŠAJEV gins daktaro disertaciją „Variacinė elektroninių sužadinimų pernašos ir relaksacijos teorija”.

Mokslinis vadovas – prof. dr. Darius Abramavičius (Vilniaus universitetas).

Disertacijos gynimo tarybos sudėtis:

Pirmininkas – prof. habil. dr. Saulius Antanas Juršėnas (Vilniaus universitetas);

1. Jogundas Armaitis (Vilniaus universitetas);
2. Thomas Gajdosik (Vilniaus universitetas);
3. Tomaš Mančal (Prahos Karolio universitetas);
4. Julius Ruseckas (Vilniaus universitetas).

Kviečiame dalyvauti

Transfer of Vibrational Coherence through Incoherent Energy Transfer Processes

Pavadinimas: Transfer of Vibrational Coherence through Incoherent Energy Transfer Processes.

Pranešėjas: prof. Tomaš Mančal (Charles University, Praha).

Santrauka:

Nuclear dynamics of molecules plays an important quantitative role in formation of third order non-linear response of molecular aggregates. While functional role of underdamped nuclear modes in photosynthetic energy transfer can be contested in many cases, multi-dimensional spectroscopy readily reveals nuclear features in practically all molecular systems. We present a discussion of coherent vibrational features in 2D Fourier transformed electronic  spectra which are a consequence of energy transfer. We will discuss their unusual dependence on energy transfer rates in weakly resonantly coupled systems and a prospect of finding and classifying such signals in general molecular aggregates.

Data, laikas  ir vieta: 2017-11-23, 16:00, NFTMC D401 auditorija.

Biomolekulių suminio dažnio generacijos spektroskopija

Kviečiame į  intriguojantį Cheminės fizikos seminarą, kuris vyks ateinantį trečiadienį, lapkričio 22 d., 12:00 val. NFTMC B336 seminarų kambaryje.

Pranešėjas: dr. Simona Strazdaitė [FTMC]

Tema: Biomolekulių suminio dažnio generacijos spektroskopija

Anotacja: Netiesinė virpesinė suminio dažnio generacijos spektroskopija (SDG) įgalina vos kelių molekulių storio sluoksnio paviršių tyrimus, kurių neįmanoma realizuoti klasikinės tiesinės spektroskopijos metodais. Šiame pranešime bus pristatyti SDG spektroskopijos principai, ypatumai ir šio metodo pritaikymas įvairių skysčių paviršiams tirti. Kaip pavyzdys bus pateiktas amino rūgščių disociacijos palyginimas skysčio paviršiuje ir tūryje ir aptarti ateities planai – SDG spektroskopijos taikymas nustatant baltymų agregacijos dėsningumus fazių riboje membrana/skystis.

Maloniai kviečiame dalyvauti ir dalintis šia žinia.

Kodėl augalai nesudega?

Vytauto Abramavičiaus disertacijos “Energijos ir krūvio pernašos teorija organinėse molekulinėse sistemose“ gynimas

Poryt, ketvirtadienį, Lapkričio 9 d. 15 val. NFTMC A101 salėje, Saulėtekio al. 3, vyks Vytauto Abramavičiaus disertacijos “Energijos ir krūvio pernašos teorija organinėse molekulinėse sistemose“ gynimas.

Mokslinis vadovas – prof. dr. Darius Abramavičius (Vilniaus universitetas).
Disertacijos gynimo taryba:
Pirmininkas – prof. habil. dr. Gintautas Tamulaitis (Vilniaus universitetas), prof. habil. dr. Vytautas Balevičius (Vilniaus universitetas), prof. habil. dr. Kęstutis Pyragas (Fizinių ir technologijos mokslų centras), prof. dr. Vytautas Karpus (Fizinių ir technologijos mokslų centras), prof. dr. Michael Thorwart (Hamburgo universitetas, Vokietija).

Kviečiame dalyvauti