DNR užuolaidos – platforma DNR ir baltymų tyrimams pavienių molekulių fluorescencinei mikroskopijai.
Pavadinimas: DNR užuolaidos – platforma DNR ir baltymų tyrimams pavienių molekulių fluorescencinei mikroskopijai.
Pranešėjas: Marijonas Tutkus.
Santrauka:
Baltymų ir nukleorūgščių (NR) sąveika yra svarbi visų pagrindinių ląstelės funkcijų reguliacijai. Šiuolaikiniai pavienių molekulių fluorescencinės mikroskopijos (PMFM) metodai leidžia realiu laiku studijuoti individualios baltymo molekulės elgesį surišant NR taikinį. Tačiau šie metodai yra techniškai sudėtingi ir juos ne visada pasiseka lengvai pritaikyti. PM eksperimentų metu, dėl neigiamos paviršiaus ar žymėjimo įtakos Tiriamosioms molekulėms, dažnai sunku surinkti tiek duomenų kad registruojami pokyčiai būtų statistiškai reikšmingi. „DNR užuolaidos” yra tolimesnis PMFM metodo vystymosi etapas, kuris leidžia pasiekti didesnį tyrimo našumą. „DNR užuolaidos“ yra prie stiklo pritvirtinti ir tam tikru būdu išdėstyti NR fragmentai, kurie ištiesiami horizontaliai paviršiui naudojant buferio tėkme. Pritvirtintų NR fragmentų išsidėstymą ir tankį galima reguliuoti. Ant šios platformos užleidus fluorescentiškai žymėtą baltymą, sąveiką su NR galima stebėti tiesiogiai PMFM pagalba. Metodas leidžia išvengti sudėtingo tiriamo baltymo žymėjimo – užtenka prijungti kvantinį tašką (KT) prie baltymo. Numatoma, kad mūsų platforma pirma bus išbandyta naudojant anksčiau charakterizuotus su NR sąveikaujančius baltymus (BcnI, Bse634), o vėliau pritaikyta ir naujiem objektams. Matavimo sistema leidžia stebėti iškart daug individualių baltymo ir NR sąveikų. Šio naujo metodo potencialas NR – baltymų sąveikos tyrimams yra didžiulis (atskleidžia informaciją apie taikinio paieškos mechanizmus, sąveikos konstantas ir kt.) ir todėl jis nenustojamai vystomas.
Čia pristatysiu unikalią stiklo paviršiaus nanostruktūrizavimo technologiją, leidžiančią sukurti „DNR užuolaidų“ platformą įvairioms NR ir baltymų sąveikoms tirti PMFM pagalba. Taip pat pristatysiu technines kliūtis, su kuriomis susiduriame šiuo metu optimizuodami paviršiaus modifikavimo ir struktūrizavimo metodus. Bei pateiksiu metodo taikymo pavyzdžių.
Data, laikas ir vieta: 2017-12-15, 14:00, NFTMC A101 auditorija.
Organizuoja: MDFS ir VU FF TFK (Cheminės fizikos institutas).
Kontaktai: marijonas.tutkus@ftmc.lt
